يستخدم تحليل المغنيسيوم في تشخيص اضطرابات البوتاسيوم والصوديوم والفسفور، أو هرمون الغدة الجار الدرقية الذي له دور في تنظيم مستوى الكالسيوم.
يستخدم تحليل المغنيسيوم في الدم في تشخيص اضطرابات الجهاز الهضمي، أو عدم التحكم في مرض السكري، أو كجزء من فحوصات تقييم مشاكل الكلى.