يستخدم تحليل فحص السيلياك لتشخيص مرض الداء البطني (بالإنجليزية: Celiac Disease) الذي يعتبر أحد أمراض المناعة الذاتية (بالإنجليزية: Autoimmune Disease)، ويعاني المصابون منه بإظهار أجسامهم لرد فعل مناعي عند تناول أي صنف من طعام يحتوي على بروتين الجلوتين (بالإنجليزية: Gluten) والموجود بشكل أساسي في القمح والشعير.